1 : Le premier jour est le tout premier épisode de la série Scrubs.
Le Docteur JD démarre son premier jour à l'Hôpital du Sacrée Coeur (Sacred Heart Hospital) après trois années d'études en médecine. C'est également le premier jour en tant que chirurgien de Chris Turk, le meilleur ami de JD. Ils rencontrent une autre interne, Elliot Reid. Chris commence a flirté avec Carla une infirmière à l'hôpital alors que JD rencontre Perry Cox un docteur sarcastique qui le fera paniquer.
2 : Après deux semaines à l'hopital Chris s appercoit que "JD" a quelques vues sur Elliot.Alors que Chris lui commence a devenir amoureux de l infirmière Carla.Quant à "JD" il obtient un nouveau patient Will Forte un fumeur avec un cancer du poumon.
3 : J.D. doute de la réussite d'une opération de Turk. Elliot commence, quant à elle, à craindre les remarques du docteur Kelso. Elle demande donc conseil au docteur Cox.
4 : J.D., Turk et Elliot se voient chacun confier un nouveau patient à l'état préoccupant. Si cette expérience rapproche Elliot et Carla, J.D. a du mal à gérer sa malade de 74 ans, tandis que Turk n'arrive pas à dire la vérité à son nouvel ami. Une grande leçon de vie en perspective...
5 : J.D. dénonce une tentative de détournement d'assurance. Si Kelso le félicite, Cox prouve à J.D. que le directeur ne pense plus à l'intéret des malades mais aux finances de l'hopital. Elliot expérimente une nouvelle thérapie (exhiber sa poitrine aux patients). Turk veut gagner la confiance de Carla et lui prouver qu'il la connait mieux que personne.
6 : Suite à la suspension de Cox le conseil juridique de l'hopital doit se réunir pour déterminer du sort du mentor de J.D.. Ce dernier se voit confier par Kelso la terrible Jordan qui siège à ce conseil. J.D. tente de sauver le docteur Cox en convainquant Jordan mais ne se doute pas du lien qui uni ces deux personnes. Elliot stresse et se confie à l'oreille de son nouveau patient: un psychanaliste. Turk et Carla vivent le parfait amour mais la mère de cette dernière se met entre eux.
7 : J.D. s'habitue de mieux en mieux à son travail d'interne et commence à prendre la grosse tête. Mais très vite un autre interne, Nick, se retrouve en pleine lumière. Turk se remet en question suite à un incident en salle d'opération. Cox le conseil mais culpabilise vis à vis de Carla.
8 : J.D. et Turk sont en pleine lumière médiatique. Kelso en profite pour faire de la publicité. Turk est gèné car il sent qu'on accentue le fait qu'il soit un médecin noir. Carla pose un lapin à Elliot pour ne pas sortir avec celle-ci mais la supercherie est découverte. J.D. tente, tant bien que mal, d'obtenir son évaluation de la part de Cox.
9 : Au cours d'une soirée, J.D. tombe malade. Le diagnostique tombe: c'est une appendicite. Turk est de garde mais J.D. s'oppose à ce que son ami l'opère. Carla conseillle à Elliot de se montrer plus attentive et moins distante avec ses patients. Cox retrouve, quant à lui, son ancien chef de service.
10 : Le concierge s'est mis en tête de donner un surnom à J.D.. Celui-ci commence à croire que ses connaissances sont supérieures à celle de Carla et réclame plus de respect. Elliot et Cox diffèrent sur l'hospitalisation d'une patiente pour le moins stressée. Turk a découvert un endroit parfait pour déjeuner: le banc public juste devant l'entrée de l'hopital. Mais Kelso est déjà le "propriétaire" de ce banc...
11 : C'est le soir de Noel. Si Turk voit dans le réveil d'un comateux un miracle, J.D. ne prête que peu d'attention à la foi. Mais très vite Turk déchante et commence à douter de l'existence de Dieu. J.D. se voit offrir par Cox le pénible travail de filmer l'acouchement d'un couple d'amis. Elliot est inquiète car elle ne sait pas comment annoncer à une de ses patiente une grossesse.
12 : Une soirée de garde pour tous les internes. Mais Cox met la barre haut et demande à ce que tous les patients soient encore vivants à minuit. Kelso oblige J.D. à s'occupper d'une assistante sociale qui risque de porter plainte contre l'hopital. Mais celle-ci est coincée dans un irm. Elliot panique car Cox ne lui fait pas assez confiance. Carla, quant à elle, se demande pourquoi Turk lui fait de nombreux reproches et pourquoi il ne souhaite pas passer la nuit avec elle.
13 : J.D. découvre le visage d'Alex et est très heureux de trouver une belle jeune femme sous cet IRM. Mais, le temps manque toujours à J.D. pour conclure car le Dr. Cox lui réclame de travail. Celui-ci vient d'ailleur d'être obliger de faire la tournée des malades à la place de Kelso. Mais, la méthode Kelso diffère beaucoup de ses principes. Carla et Turk n'arivent plus à avoir de rapports depuis qu'ils se disent "Je t'aime".
14 : J.D. et Elliot ne sont pas d'accord sur le traitement à donner à un patient toxicomane. J.D. pense qu'il faut savoir faire confiance tout comme Alex avec laquelle il est de plus en plus proche. Turk et Cox découvrent qu'ils ont envie d'uriné au même moment. Carla se fait emmener à l'hopital par Kelso et, étrangement, apprécie l'homme.
